Maestros del SUTEP en Ayacucho fueron víctimas de detenciones, desapariciones y muertes durante el conflicto armado interno, lo que llevó al sindicato a presentar denuncias ante autoridades nacionales e internacionales.
En 1991, varios profesores afiliados al Sindicato Único de Trabajadores de la Educación Peruana fueron desaparecidos forzadamente por agentes del Estado como parte de la estrategia contrasubversiva.
En 1993, el Gobierno del Perú ratificó el Convenio Nº 169 de la OIT sobre Pueblos Indígenas y Tribales, comprometiéndose a proteger los derechos territoriales y culturales de las poblaciones indígenas.